大規模行列にも対応!PyTorchで疎行列と稠密行列を高速処理する`torch.Tensor.sspaddmm`


C = A @ B + A

ここで、

  • B は入力行列 (稠密行列)
  • A は入力行列 (疎行列)
  • C は出力行列

となります。

torch.Tensor.sspaddmmの利点

torch.Tensor.sspaddmmは、以下の利点があります。

  • 計算量が少ないため、大規模な行列に対しても効率的に処理することができます。
  • 疎行列の構造を維持することができます。
  • 疎行列と稠密行列の積算を効率的に行うことができます。

torch.Tensor.sspaddmmは以下の引数を取ります。

  • beta: 結果に元の疎行列を加算する際の係数 (デフォルトは1)
  • alpha: 疎行列入力と結果の積に掛ける係数 (デフォルトは1)
  • mat2: 稠密行列入力
  • mat1: 疎行列入力

torch.Tensor.sspaddmmの戻り値は、出力行列Cです。

import torch
import torch.sparse

# 疎行列と稠密行列を作成
mat1 = torch.sparse.csr_matrix((data, indices, indptr), shape=(m, n))
mat2 = torch.randn(n, k)

# torch.Tensor.sspaddmmを実行
C = torch.sspaddmm(mat1, mat2)

# 結果を出力
print(C)

この例では、mat1mat2の行列積を計算し、その結果にmat1を加算しています。



import torch
import torch.sparse

# 疎行列と稠密行列を作成
m = 1000  # 行数
n = 100  # 列数
k = 50  # 出力列数

data = torch.randn(m * n)
indices = torch.LongTensor([torch.arange(n), torch.randint(0, n, (m,))])
indptr = torch.LongTensor([0] + torch.arange(m + 1) * n)
mat1 = torch.sparse.csr_matrix((data, indices, indptr), shape=(m, n))
mat2 = torch.randn(n, k)

# torch.Tensor.sspaddmmを実行
alpha = 0.5  # 疎行列入力と結果の積に掛ける係数
beta = 1.0  # 結果に元の疎行列を加算する際の係数
C = torch.sspaddmm(mat1, mat2, alpha=alpha, beta=beta)

# 結果を出力
print(C.size())  # 出力行列のサイズを出力

このコードは以下の処理を実行します。

  1. 疎行列mat1と稠密行列mat2を作成します。
  2. torch.Tensor.sspaddmmを実行し、疎行列と稠密行列の積算と、その結果に元の疎行列を加算します。
  3. 結果行列のサイズを出力します。
  • 係数alphabetaをカスタマイズする
  • 結果に元の疎行列を加算しない
  • 疎行列と稠密行列の積算のみを行う

疎行列と稠密行列の積算のみを行う

import torch
import torch.sparse

# 疎行列と稠密行列を作成
m = 1000
n = 100
k = 50

data = torch.randn(m * n)
indices = torch.LongTensor([torch.arange(n), torch.randint(0, n, (m,))])
indptr = torch.LongTensor([0] + torch.arange(m + 1) * n)
mat1 = torch.sparse.csr_matrix((data, indices, indptr), shape=(m, n))
mat2 = torch.randn(n, k)

# torch.Tensor.sspaddmmを実行
C = torch.sspaddmm(mat1, mat2, alpha=1.0, beta=0.0)  # betaを0に設定

# 結果を出力
print(C.size())

結果に元の疎行列を加算しない

import torch
import torch.sparse

# 疎行列と稠密行列を作成
m = 1000
n = 100
k = 50

data = torch.randn(m * n)
indices = torch.LongTensor([torch.arange(n), torch.randint(0, n, (m,))])
indptr = torch.LongTensor([0] + torch.arange(m + 1) * n)
mat1 = torch.sparse.csr_matrix((data, indices, indptr), shape=(m, n))
mat2 = torch.randn(n, k)

# torch.Tensor.sspaddmmを実行
C = torch.sspaddmm(mat1, mat2, alpha=1.0, beta=0.0)  # betaを0に設定

# 結果を出力
print(C.size())
import torch
import torch.sparse

# 疎行列と稠密行列を作成
m = 1000
n = 100
k = 50

data = torch.randn(m * n)
indices = torch.LongTensor([torch.arange(n), torch.randint(0, n, (m,))])
indptr = torch.LongTensor([0] + torch.arange(m + 1) * n)
mat1 = torch.sparse.csr_matrix((data, indices, indptr), shape=(m, n))


代替方法の選択

torch.Tensor.sspaddmmの代替方法を選択する際には、以下の要素を考慮する必要があります。

  • 精度: torch.Tensor.sspaddmmは、デフォルトで32ビット浮動小数点精度を使用します。より高い精度が必要な場合は、dtype引数を使用して精度を指定することができます。
  • ハードウェア: GPUを使用している場合は、torch.cuda.sparse.spmmなどのGPU専用の関数を使用することで、計算速度を向上させることができます。
  • 行列のサイズと密度: 行列のサイズと密度が大きくなるほど、torch.Tensor.sspaddmmの計算コストが高くなります。

以下に、torch.Tensor.sspaddmmの代替方法の例をいくつか紹介します。

  • カスタムカーネル: より複雑な操作を行う場合は、カスタムカーネルを作成することができます。これは、最も効率的な方法ですが、実装が複雑になります。
  • torch.cuda.sparse.spmm: GPU上で疎行列と疎行列の積算を行う関数です。torch.Tensor.sspaddmmよりも高速に計算を行うことができますが、CPU上では使用できません。
  • torch.sparse.mm: 疎行列と疎行列の積算を行う関数です。torch.Tensor.sspaddmmよりも効率的に計算を行うことができますが、結果に元の疎行列を加算することはできません。
  • データ形式: 疎行列を効率的に処理するには、適切なデータ形式を使用することが重要です。PyTorchでは、torch.sparse.csr_matrixなどの様々なデータ形式が用意されています。
  • ライブラリ: scipy.sparseなどのライブラリには、疎行列演算用の様々な関数が用意されています。これらのライブラリを使用することで、PyTorch内で実装されている関数よりも効率的に計算を行うことができる場合があります。